Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX4P57082 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX4P57082 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX4P57082 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX4P57082 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBX4P57082 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX4P57082 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX4P57082 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBX4P57082 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBX4P57082 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBX4P57082 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX4P57082 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX4P57082 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX4P57082 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX4P57082 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX4P57082 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX4P57082 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX4P57082 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX4P57082 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX4P57082 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX4P57082 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX4P57082 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX4P57082 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX4P57082 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX4P57082 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX4P57082 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX4P57082 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX4P57082 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX4P57082 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX4P57082 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX4P57082 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX4P57082 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX4P57082 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX4P57082 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX4P57082 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX4P57082 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX4P57082 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX4P57082 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX4P57082 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX4P57082 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX4P57082 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX4P57082 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX4P57082 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX4P57082 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX4P57082 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX4P57082 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX4P57082 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX4P57082 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX4P57082 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX4P57082 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX4P57082 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms