Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NRG3P56975 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NRG3P56975 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NRG3P56975 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG3P56975 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG3P56975 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG3P56975 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG3P56975 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG3P56975 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG3P56975 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NRG3P56975 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRG3P56975 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NRG3P56975 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NRG3P56975 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NRG3P56975 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG3P56975 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG3P56975 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG3P56975 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG3P56975 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG3P56975 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG3P56975 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NRG3P56975 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NRG3P56975 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG3P56975 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NRG3P56975 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms