Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH15P55291 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH15P55291 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH15P55291 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH15P55291 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH15P55291 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH15P55291 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH15P55291 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH15P55291 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH15P55291 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH15P55291 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH15P55291 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH15P55291 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH15P55291 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH15P55291 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH15P55291 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH15P55291 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH15P55291 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH15P55291 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH15P55291 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH15P55291 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH15P55291 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH15P55291 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH15P55291 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH15P55291 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH15P55291 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH15P55291 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH15P55291 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH15P55291 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH15P55291 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH15P55291 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH15P55291 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH15P55291 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH15P55291 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH15P55291 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH15P55291 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH15P55291 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH15P55291 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH15P55291 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH15P55291 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH15P55291 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH15P55291 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH15P55291 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH15P55291 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms