Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ELLP55199 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ELLP55199 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ELLP55199 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELLP55199 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELLP55199 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELLP55199 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ELLP55199 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELLP55199 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ELLP55199 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ELLP55199 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ELLP55199 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ELLP55199 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ELLP55199 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ELLP55199 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ELLP55199 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ELLP55199 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ELLP55199 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ELLP55199 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ELLP55199 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ELLP55199 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ELLP55199 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ELLP55199 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ELLP55199 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ELLP55199 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms