Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPAP53621 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPAP53621 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPAP53621 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPAP53621 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPAP53621 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPAP53621 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPAP53621 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPAP53621 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPAP53621 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPAP53621 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPAP53621 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPAP53621 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPAP53621 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPAP53621 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COPAP53621 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPAP53621 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPAP53621 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPAP53621 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPAP53621 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPAP53621 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPAP53621 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPAP53621 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPAP53621 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPAP53621 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPAP53621 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPAP53621 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPAP53621 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPAP53621 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPAP53621 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPAP53621 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPAP53621 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPAP53621 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COPAP53621 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPAP53621 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPAP53621 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPAP53621 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPAP53621 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPAP53621 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPAP53621 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPAP53621 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPAP53621 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPAP53621 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPAP53621 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPAP53621 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPAP53621 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms