Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRIP2P52943 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP2P52943 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms