Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST1P52848 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST1P52848 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST1P52848 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST1P52848 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST1P52848 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST1P52848 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST1P52848 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST1P52848 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST1P52848 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST1P52848 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST1P52848 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST1P52848 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST1P52848 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST1P52848 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST1P52848 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST1P52848 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST1P52848 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST1P52848 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST1P52848 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST1P52848 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST1P52848 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST1P52848 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST1P52848 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST1P52848 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST1P52848 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDST1P52848 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST1P52848 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST1P52848 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST1P52848 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST1P52848 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms