Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN6P51797 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCN6P51797 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN6P51797 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms