Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN4P51793 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN4P51793 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCN4P51793 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms