Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA4P51532 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA4P51532 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SMARCA4P51532 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SMARCA4P51532 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms