Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PPT1P50897 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPT1P50897 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPT1P50897 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPT1P50897 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPT1P50897 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPT1P50897 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPT1P50897 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPT1P50897 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPT1P50897 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPT1P50897 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPT1P50897 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPT1P50897 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPT1P50897 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPT1P50897 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPT1P50897 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPT1P50897 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPT1P50897 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPT1P50897 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPT1P50897 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPT1P50897 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPT1P50897 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms