Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLK2P49760 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLK2P49760 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLK2P49760 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLK2P49760 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLK2P49760 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK2P49760 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK2P49760 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK2P49760 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK2P49760 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK2P49760 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK2P49760 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLK2P49760 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLK2P49760 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLK2P49760 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLK2P49760 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK2P49760 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK2P49760 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK2P49760 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK2P49760 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLK2P49760 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK2P49760 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK2P49760 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK2P49760 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLK2P49760 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLK2P49760 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLK2P49760 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK2P49760 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK2P49760 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK2P49760 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK2P49760 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK2P49760 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK2P49760 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLK2P49760 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLK2P49760 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK2P49760 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK2P49760 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK2P49760 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK2P49760 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK2P49760 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLK2P49760 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLK2P49760 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK2P49760 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms