Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP4P49662 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP4P49662 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP4P49662 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP4P49662 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP4P49662 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP4P49662 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP4P49662 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP4P49662 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP4P49662 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP4P49662 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP4P49662 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP4P49662 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP4P49662 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP4P49662 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP4P49662 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP4P49662 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP4P49662 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP4P49662 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP4P49662 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP4P49662 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP4P49662 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP4P49662 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP4P49662 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASP4P49662 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP4P49662 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP4P49662 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP4P49662 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP4P49662 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP4P49662 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASP4P49662 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASP4P49662 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASP4P49662 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP4P49662 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP4P49662 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASP4P49662 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms