Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC11A1P49279 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC11A1P49279 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms