Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ALDH9A1P49189 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALDH9A1P49189 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms