Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNI2P48788 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNI2P48788 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms