Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RXRGP48443 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RXRGP48443 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RXRGP48443 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RXRGP48443 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RXRGP48443 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RXRGP48443 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RXRGP48443 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RXRGP48443 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RXRGP48443 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RXRGP48443 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RXRGP48443 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RXRGP48443 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RXRGP48443 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RXRGP48443 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RXRGP48443 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RXRGP48443 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RXRGP48443 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RXRGP48443 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RXRGP48443 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RXRGP48443 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RXRGP48443 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms