Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSFMP43897 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSFMP43897 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSFMP43897 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSFMP43897 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSFMP43897 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSFMP43897 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSFMP43897 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSFMP43897 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSFMP43897 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSFMP43897 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSFMP43897 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSFMP43897 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSFMP43897 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TSFMP43897 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSFMP43897 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSFMP43897 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSFMP43897 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSFMP43897 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSFMP43897 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSFMP43897 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSFMP43897 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSFMP43897 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSFMP43897 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSFMP43897 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSFMP43897 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSFMP43897 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSFMP43897 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSFMP43897 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms