Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA1P42261 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA1P42261 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA1P42261 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA1P42261 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA1P42261 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIA1P42261 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIA1P42261 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIA1P42261 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms