Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMPOP42166 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMPOP42166 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMPOP42166 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMPOP42166 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMPOP42166 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMPOP42166 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMPOP42166 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMPOP42166 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMPOP42166 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMPOP42166 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMPOP42166 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TMPOP42166 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMPOP42166 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMPOP42166 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMPOP42166 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMPOP42166 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TMPOP42166 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMPOP42166 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMPOP42166 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMPOP42166 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMPOP42166 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMPOP42166 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMPOP42166 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMPOP42166 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMPOP42166 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMPOP42166 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMPOP42166 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TMPOP42166 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMPOP42166 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMPOP42166 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMPOP42166 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMPOP42166 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMPOP42166 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMPOP42166 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMPOP42166 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMPOP42166 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMPOP42166 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMPOP42166 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMPOP42166 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMPOP42166 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMPOP42166 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMPOP42166 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TMPOP42166 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMPOP42166 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMPOP42166 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMPOP42166 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMPOP42166 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMPOP42166 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMPOP42166 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMPOP42166 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMPOP42166 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMPOP42166 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMPOP42166 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMPOP42166 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms