Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOBEC1P41238 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms