Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 THI12YNL332W 1023 nt5.73□□□□□ -1.49
VID28P40547 AME1YBR211C 975 nt5.73□□□□□ -1.49
VID28P40547 CLB5YPR120C 1308 nt5.73□□□□□ -1.49
VID28P40547 YPK3YBR028C 1578 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 STE12YHR084W 2067 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 TRS23YDR246W 660 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 NSG1YHR133C 876 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 YNR042WYNR042W 429 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 VAM3YOR106W 852 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 SSP2YOR242C 1116 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 MET31YPL038W 534 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 MCH4YOL119C 1506 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 YJR124CYJR124C 1347 nt5.72□□□□□ -1.49
VID28P40547 RSC6YCR052W 1452 nt5.71□□□□□ -1.49
VID28P40547 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.71□□□□□ -1.5
VID28P40547 PRE7YBL041W 726 nt5.71□□□□□ -1.5
VID28P40547 PDB1YBR221C 1101 nt5.71□□□□□ -1.5
VID28P40547 UGA1YGR019W 1416 nt5.71□□□□□ -1.5
VID28P40547 ABD1YBR236C 1311 nt5.71□□□□□ -1.5
VID28P40547 NOT3YIL038C 2511 nt5.71□□□□□ -1.5
VID28P40547 OCA5YHL029C 2040 nt5.7□□□□□ -1.5
VID28P40547 NSE3YDR288W 912 nt5.7□□□□□ -1.5
VID28P40547 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.7□□□□□ -1.5
VID28P40547 YMR010WYMR010W 1218 nt5.7□□□□□ -1.5
VID28P40547 YNL019CYNL019C 855 nt5.7□□□□□ -1.5
VID28P40547 YNL033WYNL033W 855 nt5.7□□□□□ -1.5
VID28P40547 PRT1YOR361C 2292 nt5.7□□□□□ -1.5
VID28P40547 CAF16YFL028C 870 nt5.69□□□□□ -1.5
VID28P40547 ADH4YGL256W 1149 nt5.69□□□□□ -1.5
VID28P40547 YJL171CYJL171C 1191 nt5.69□□□□□ -1.5
VID28P40547 MDG1YNL173C 1101 nt5.69□□□□□ -1.5
VID28P40547 PCL1YNL289W 840 nt5.69□□□□□ -1.5
VID28P40547 COX11YPL132W 903 nt5.69□□□□□ -1.5
VID28P40547 YNL095CYNL095C 1929 nt5.69□□□□□ -1.5
VID28P40547 HXT14YNL318C 1623 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 YHR022CYHR022C 771 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 MRT4YKL009W 711 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 YLR036CYLR036C 612 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 RPS31YLR167W 459 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 MID2YLR332W 1131 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 YMR245WYMR245W 621 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 DSC2YOL073C 969 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 ANT1YPR128C 987 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 UBS1YBR165W 834 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 YIL067CYIL067C 2037 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 SIP5YMR140W 1470 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 FHL1YPR104C 2811 nt5.68□□□□□ -1.5
VID28P40547 MUP3YHL036W 1641 nt5.67□□□□□ -1.5
VID28P40547 HOS1YPR068C 1413 nt5.67□□□□□ -1.5
VID28P40547 PUS6YGR169C 1215 nt5.67□□□□□ -1.5
VID28P40547 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.67□□□□□ -1.5
VID28P40547 CAM1YPL048W 1248 nt5.67□□□□□ -1.5
VID28P40547 TOM5YPR133W-A 153 nt5.67□□□□□ -1.5
VID28P40547 FRE3YOR381W 2136 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 ELP2YGR200C 2367 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 MMT2YPL224C 1455 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 YCR099CYCR099C 468 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 SLC1YDL052C 912 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 RPL28YGL103W 450 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 MRP13YGR084C 1020 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 ARP1YHR129C 1155 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 YHR214WYHR214W 612 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 DAN1YJR150C 897 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 YLR124WYLR124W 345 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 YLR225CYLR225C 1224 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 YAR066WYAR066W 612 nt5.66□□□□□ -1.5
VID28P40547 UGA2YBR006W 1494 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 YDL026WYDL026W 312 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 YDR222WYDR222W 1248 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 TRP4YDR354W 1143 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 COX17YLL009C 210 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 SNO1YMR095C 675 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 TLG2YOL018C 1194 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 ZPS1YOL154W 750 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 IRC14YOR135C 342 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 YDC1YPL087W 954 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 ROT2YBR229C 2865 nt5.65□□□□□ -1.5
VID28P40547 PWP1YLR196W 1731 nt5.65□□□□□ -1.51
VID28P40547 IXR1YKL032C 1794 nt5.65□□□□□ -1.51
VID28P40547 YHL012WYHL012W 1482 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 YDR161WYDR161W 1164 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 HSP31YDR533C 714 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 YER187WYER187W 426 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 MRPL6YHR147C 645 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 MRPS8YMR158W 468 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 LTO1YNL260C 597 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 YNL296WYNL296W 315 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 CUE5YOR042W 1236 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 GPI2YPL076W 843 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 MGS1YNL218W 1764 nt5.64□□□□□ -1.51
VID28P40547 YDR417CYDR417C 372 nt5.63□□□□□ -1.51
VID28P40547 MRF1YGL143C 1242 nt5.63□□□□□ -1.51
VID28P40547 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.63□□□□□ -1.51
VID28P40547 MDY2YOL111C 639 nt5.63□□□□□ -1.51
VID28P40547 YPL073CYPL073C 486 nt5.63□□□□□ -1.51
VID28P40547 YPL168WYPL168W 1293 nt5.63□□□□□ -1.51
VID28P40547 NRG2YBR066C 663 nt5.63□□□□□ -1.51
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