Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX2P40425 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX2P40425 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX2P40425 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX2P40425 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX2P40425 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX2P40425 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX2P40425 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX2P40425 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX2P40425 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBX2P40425 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBX2P40425 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBX2P40425 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PBX2P40425 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBX2P40425 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PBX2P40425 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PBX2P40425 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PBX2P40425 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBX2P40425 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBX2P40425 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PBX2P40425 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PBX2P40425 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBX2P40425 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBX2P40425 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBX2P40425 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBX2P40425 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBX2P40425 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PBX2P40425 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PBX2P40425 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PBX2P40425 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PBX2P40425 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PBX2P40425 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PBX2P40425 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBX2P40425 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBX2P40425 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBX2P40425 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBX2P40425 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PBX2P40425 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PBX2P40425 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PBX2P40425 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PBX2P40425 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms