Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 ARO9YHR137W 1542 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 DED81YHR019C 1665 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 DOA1YKL213C 2148 nt4.34□□□□□ -1.71
AVT5P38176 KRE6YPR159W 2163 nt4.34□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MDR1YGR100W 2853 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 ESF1YDR365C 1887 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 IXR1YKL032C 1794 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 EMP46YLR080W 1335 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 COX26YDR119W-A 201 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 DIN7YDR263C 1293 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YEL028WYEL028W 462 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 CPR6YLR216C 1116 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YNL319WYNL319W 441 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YOR289WYOR289W 756 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 VPS28YPL065W 729 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 NUP116YMR047C 3342 nt4.33□□□□□ -1.72
AVT5P38176 SNF3YDL194W 2655 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YTA12YMR089C 2478 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 STD1YOR047C 1335 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 AI3Q0060 1248 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YDR161WYDR161W 1164 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 LYS5YGL154C 819 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 SPO74YGL170C 1242 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 ECM1YAL059W 639 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 NEJ1YLR265C 1029 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YLR402WYLR402W 192 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 PCL1YNL289W 840 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 DSC2YOL073C 969 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 HRT1YOL133W 366 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YPL102CYPL102C 303 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MRL1YPR079W 1146 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 QCR2YPR191W 1107 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MSH1YHR120W 2880 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 PRP28YDR243C 1767 nt4.32□□□□□ -1.72
AVT5P38176 KAP114YGL241W 3015 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 INO2YDR123C 915 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YGR016WYGR016W 573 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 CBP4YGR174C 513 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YIL028WYIL028W 399 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YKR104WYKR104W 921 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 UIP3YAR027W 708 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 NCE103YNL036W 666 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 RPA49YNL248C 1248 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 RPS19BYNL302C 435 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 GPM3YOL056W 912 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 ARG8YOL140W 1272 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 UIP4YPL186C 915 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 UBA3YPR066W 900 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 snR3snR3 194 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YCL012CYCL012C 405 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 HXT7YDR342C 1713 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 HXT6YDR343C 1713 nt4.31□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YGR266WYGR266W 2106 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 KIP2YPL155C 2121 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 TRM44YPL030W 1704 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 CAD1YDR423C 1230 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YEL045CYEL045C 426 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MPS2YGL075C 1164 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YHL045WYHL045W 348 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YLR198CYLR198C 360 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 SHP1YBL058W 1272 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 SCO1YBR037C 888 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MSE1YOL033W 1611 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 DHH1YDL160C 1521 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 STP4YDL048C 1473 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 FUM1YPL262W 1467 nt4.3□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YLF2YHL014C 1218 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YIL086CYIL086C 309 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YLL059CYLL059C 507 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MIM2YLR099W-A 264 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 TFS1YLR178C 660 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 RUF21RUF21 707 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 IBA57YJR122W 1494 nt4.29□□□□□ -1.72
AVT5P38176 HSP82YPL240C 2130 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 YDR445CYDR445C 408 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 DUO1YGL061C 744 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 WSS1YHR134W 810 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 PSR1YLL010C 1284 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MRPS8YMR158W 468 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MFA2YNL145W 117 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 ARR3YPR201W 1215 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 PCL8YPL219W 1479 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 MIF2YKL089W 1650 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 GRC3YLL035W 1899 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 VBA2YBR293W 1425 nt4.28□□□□□ -1.72
AVT5P38176 IFM1YOL023W 2031 nt4.28□□□□□ -1.73
AVT5P38176 NDC1YML031W 1968 nt4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms