Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP6V1E1P36543 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6V1E1P36543 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms