Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX11P35716 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX11P35716 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX11P35716 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX11P35716 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX11P35716 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX11P35716 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX11P35716 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX11P35716 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX11P35716 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX11P35716 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX11P35716 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX11P35716 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX11P35716 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX11P35716 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX11P35716 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX11P35716 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX11P35716 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX11P35716 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX11P35716 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX11P35716 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX11P35716 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX11P35716 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX11P35716 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms