Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF1BP35680 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF1BP35680 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF1BP35680 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF1BP35680 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF1BP35680 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF1BP35680 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF1BP35680 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HNF1BP35680 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF1BP35680 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms