Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTN2P35609 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTN2P35609 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms