Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBSP35520 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBSP35520 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBSP35520 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBSP35520 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBSP35520 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBSP35520 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBSP35520 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBSP35520 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBSP35520 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBSP35520 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBSP35520 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBSP35520 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBSP35520 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBSP35520 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBSP35520 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBSP35520 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CBSP35520 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBSP35520 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBSP35520 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBSP35520 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBSP35520 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBSP35520 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBSP35520 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBSP35520 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBSP35520 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBSP35520 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBSP35520 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBSP35520 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBSP35520 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBSP35520 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBSP35520 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CBSP35520 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBSP35520 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBSP35520 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CBSP35520 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms