Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA4P35212 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA4P35212 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA4P35212 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA4P35212 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA4P35212 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA4P35212 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA4P35212 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA4P35212 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA4P35212 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA4P35212 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA4P35212 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA4P35212 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA4P35212 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA4P35212 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA4P35212 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA4P35212 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJA4P35212 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJA4P35212 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJA4P35212 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJA4P35212 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA4P35212 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA4P35212 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA4P35212 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA4P35212 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJA4P35212 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms