Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCD1P33897 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCD1P33897 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCD1P33897 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms