Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL1P33121 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms