Protein–RNA interactions for Protein: P30838

ALDH3A1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3A1P30838 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ALDH3A1P30838 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALDH3A1P30838 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms