Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF1P30408 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TM4SF1P30408 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF1P30408 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms