Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDX3P30048 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms