Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNGA1P29973 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNGA1P29973 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNGA1P29973 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms