Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD40LGP29965 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD40LGP29965 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD40LGP29965 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms