Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PTPRMP28827 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPRMP28827 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPRMP28827 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms