Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTFRP26992 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms