Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD27P26842 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD27P26842 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD27P26842 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD27P26842 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD27P26842 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD27P26842 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD27P26842 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD27P26842 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD27P26842 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD27P26842 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD27P26842 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD27P26842 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD27P26842 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD27P26842 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD27P26842 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD27P26842 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD27P26842 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD27P26842 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD27P26842 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD27P26842 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD27P26842 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD27P26842 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD27P26842 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD27P26842 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD27P26842 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD27P26842 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD27P26842 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD27P26842 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms