Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
YY1P25490 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
YY1P25490 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
YY1P25490 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
YY1P25490 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
YY1P25490 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
YY1P25490 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YY1P25490 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YY1P25490 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
YY1P25490 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
YY1P25490 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YY1P25490 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YY1P25490 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YY1P25490 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
YY1P25490 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
YY1P25490 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YY1P25490 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
YY1P25490 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YY1P25490 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YY1P25490 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YY1P25490 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YY1P25490 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
YY1P25490 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YY1P25490 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YY1P25490 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YY1P25490 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
YY1P25490 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
YY1P25490 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YY1P25490 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
YY1P25490 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
YY1P25490 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
YY1P25490 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
YY1P25490 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
YY1P25490 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
YY1P25490 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YY1P25490 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YY1P25490 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YY1P25490 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YY1P25490 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YY1P25490 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YY1P25490 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YY1P25490 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YY1P25490 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YY1P25490 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YY1P25490 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YY1P25490 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YY1P25490 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YY1P25490 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms