Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNCP24863 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNCP24863 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNCP24863 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNCP24863 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNCP24863 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNCP24863 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNCP24863 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNCP24863 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNCP24863 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNCP24863 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNCP24863 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNCP24863 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNCP24863 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNCP24863 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCNCP24863 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNCP24863 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNCP24863 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNCP24863 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNCP24863 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNCP24863 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNCP24863 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNCP24863 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNCP24863 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNCP24863 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNCP24863 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNCP24863 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNCP24863 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNCP24863 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNCP24863 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNCP24863 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms