Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRZ1P23471 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRZ1P23471 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRZ1P23471 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRZ1P23471 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRZ1P23471 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms