Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FGFR4P22455 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGFR4P22455 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms