Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB1P20700 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB1P20700 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms