Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1D1P20393 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NR1D1P20393 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms