Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT4P19013 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT4P19013 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT4P19013 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT4P19013 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT4P19013 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT4P19013 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT4P19013 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT4P19013 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT4P19013 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT4P19013 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT4P19013 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT4P19013 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT4P19013 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT4P19013 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT4P19013 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT4P19013 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT4P19013 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT4P19013 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT4P19013 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT4P19013 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT4P19013 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT4P19013 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT4P19013 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT4P19013 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT4P19013 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT4P19013 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT4P19013 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT4P19013 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT4P19013 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT4P19013 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT4P19013 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT4P19013 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT4P19013 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT4P19013 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT4P19013 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT4P19013 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT4P19013 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT4P19013 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT4P19013 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT4P19013 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT4P19013 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT4P19013 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms