Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL3L1P16619 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL3L1P16619 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms