Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSP16219 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSP16219 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSP16219 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACADSP16219 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACADSP16219 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACADSP16219 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACADSP16219 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSP16219 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSP16219 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSP16219 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSP16219 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSP16219 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSP16219 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSP16219 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACADSP16219 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSP16219 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSP16219 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSP16219 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSP16219 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSP16219 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACADSP16219 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACADSP16219 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACADSP16219 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSP16219 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms