Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD44P16070 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD44P16070 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD44P16070 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD44P16070 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CD44P16070 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD44P16070 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD44P16070 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD44P16070 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CD44P16070 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD44P16070 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD44P16070 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD44P16070 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD44P16070 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD44P16070 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD44P16070 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD44P16070 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD44P16070 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD44P16070 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD44P16070 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD44P16070 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD44P16070 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD44P16070 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD44P16070 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD44P16070 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD44P16070 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD44P16070 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD44P16070 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD44P16070 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD44P16070 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD44P16070 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CD44P16070 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD44P16070 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD44P16070 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD44P16070 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD44P16070 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD44P16070 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD44P16070 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD44P16070 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD44P16070 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD44P16070 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD44P16070 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD44P16070 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD44P16070 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD44P16070 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms